Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HCN3Q9P1Z3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms