Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CYLDQ9NQC7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CYLDQ9NQC7 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms