Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NUP58Q9BVL2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms