Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNRNP25Q9BV90 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms