Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CCDC85AQ96PX6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms