Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SUSD3Q96L08 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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SUSD3Q96L08 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SUSD3Q96L08 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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