Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 TTC23L-209ENST00000638320 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERVK_113Q902F9 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms