Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TMIEQ8NEW7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TMIEQ8NEW7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms