Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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C9orf40Q8IXQ3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
C9orf40Q8IXQ3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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