Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC134312.1-201ENST00000378417 3468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LRIG3Q6UXM1 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms