Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZHG4

FNDC1, Fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC1Q4ZHG4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
FNDC1Q4ZHG4 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms