Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C5orf22Q49AR2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms