Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
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NDUFA9Q16795 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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NDUFA9Q16795 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NDUFA9Q16795 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NDUFA9Q16795 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
NDUFA9Q16795 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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NDUFA9Q16795 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
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