Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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HIST3H3Q16695 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HIST3H3Q16695 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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