Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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NCOA1Q15788 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NCOA1Q15788 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NCOA1Q15788 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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