Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PCOLCEQ15113 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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