Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
POLD3Q15054 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms