Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
FHL3Q13643 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
FHL3Q13643 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms