Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

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Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
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MTMR3Q13615 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
MTMR3Q13615 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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