Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GRIK3Q13003 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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