Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FOXF2Q12947 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FOXF2Q12947 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FOXF2Q12947 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FOXF2Q12947 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FOXF2Q12947 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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FOXF2Q12947 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF2Q12947 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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