Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
APOBRQ0VD83 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms