Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ADGRL1-201ENST00000340736 7853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 FBN3-207ENST00000601739 9086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 XPOT-201ENST00000332707 6414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IFFO1Q0D2I5 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms