Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNA1Q09470 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms