Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PPP3CAQ08209 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPP3CAQ08209 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms