Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
SRSF4Q08170 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms