Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POU5F1Q01860 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms