Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ACTG1P63261 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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