Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PSMC1P62191 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms