Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
CHRNA7P36544 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms