Protein–RNA interactions for Protein: P34897

SHMT2, Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHMT2P34897 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SHMT2P34897 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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