Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC010531.8-201ENST00000623341 685 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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PTPRMP28827 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 RPAIN-202ENST00000381208 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRMP28827 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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