Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SYT1P21579 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms