Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 HLA-DQB3-203ENST00000425319 356 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 RN7SL794P-201ENST00000469816 280 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 CDK7-211ENST00000514676 1164 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 CLDN6-203ENST00000572154 461 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC021072.1-201ENST00000635789 835 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 OR8B8-201ENST00000328064 1033 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 KDM5C-IT1-201ENST00000412242 755 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC246817.2-204ENST00000517984 562 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 AL133453.1-201ENST00000554055 581 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 KRT8P34-201ENST00000577607 1044 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC020910.4-201ENST00000612269 540 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRHP20396 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 MMP19-202ENST00000409200 1431 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 AL133351.2-201ENST00000437718 484 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 LINC02344-201ENST00000443576 644 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRHP20396 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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