Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PRPSAP1-206ENST00000446526 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DSN1-201ENST00000373734 1915 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
CXCL2P19875 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms