Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTPN1P18031 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms