Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IFNB1P01574 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms