Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
EXTL3O43909 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms