Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREB3O43889 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREB3O43889 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CREB3O43889 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CREB3O43889 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CREB3O43889 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CREB3O43889 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms