Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
EDIL3O43854 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms