Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TO15178 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TO15178 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TO15178 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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