Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR3AO14802 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms