Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRIM38O00635 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRIM38O00635 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TRIM38O00635 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TRIM38O00635 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms