Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HHLA1C9JL84 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms