Protein–RNA interactions for Protein: A6XGL0

YJEFN3, YjeF N-terminal domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YJEFN3A6XGL0 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
YJEFN3A6XGL0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms