Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F8

CDY1, Testis-specific chromodomain protein Y 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY1Q9Y6F8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDY1Q9Y6F8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDY1Q9Y6F8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDY1Q9Y6F8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms