Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X3

SNX5, Sorting nexin-5, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX5Q9Y5X3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNX5Q9Y5X3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SNX5Q9Y5X3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SNX5Q9Y5X3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms