Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SNX10Q9Y5X0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SNX10Q9Y5X0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SNX10Q9Y5X0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms