Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TNFRSF18Q9Y5U5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TNFRSF18Q9Y5U5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms