Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CLDN16Q9Y5I7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CLDN16Q9Y5I7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms